پروسهی درمانی وی از ابتدا به دلیل فشارهای شدید ماموران از جمله اصرار به زدن دستبند و پابند، عدم تردد و انجام پیادهرویهای معمول با مشکلات متعدد مواجه و در مرحلهای به درگیری لفظی انجامید.
این عضو نهضت آزادی ایران در چند مرحله در مرکز قلب تهران بستری بوده اما هیچگاه با چنین فشارهای فیزیکی و روانی مواجه نشده بود و از آنجاییکه نگهداری وی در این مرکز در شرایط سلول انفرادی بود موجب تشدید بیماری وی به دلیل عصبانیت و برخوردهای نادرست شد.
معتمدیمهر به همین دلایل ترجیح داد که کار درمان خود را ناتمام رها کرده و به زندان برگردد. شاهدان عینی گفتند وی که تنها ۷ ماه از مدت حبساش باقی مانده تصریح کرده که اگر کوچکترین مشکلی به دلیل این رفتارهای نادرست ماموران برایش پیش بیاید این مقامات زندان و مسوولان هستند که باید جوابگو باشند.
مهدی معتمدیمهر در آبانماه سال ۱۳۹۰ و در نامهای سرگشاده به وزیر اطلاعات وقت نسبت به رفتارهای غیرقانونی بازجویان وزارت اطلاعات و احیای دوبارهی باندی شبیه به “سعید امامی”، هشدار داده بود.
